アミノ酸は、側鎖の性質によって分類することができる。
側鎖に硫黄(S)をもつ
システイン、シスチン、メチオニン
側鎖に炭化水素鎖をもつ
バリン、ロイシン、イソロイシン
側鎖にベンゼン環をもつ
フェニルアラニン、チロシン、トリプトファン
側鎖に水酸基(-OH)を持つ
セリン、トレオニン、チロシン、ヒドロキシプロリン